تعمل المندوبية الوزارية على إعداد وإبرام وتنفيذ شراكات مع مختلف الفاعلين المؤسساتيين والمدنيين المعنيين بحقوق الإنسان، وتحرص على تنويعها وتطويرها وتجويدها، سواء مع الجمعيات والمنظمات أو الهيئات والمؤسسات الوطنية والإقليمية والدولية.
وتهدف المندوبية من خلال هاته الشراكات إلى تعزيز التعاون وتقوية سبل الحوار الجاد والتفاعل البناء مع الفاعلين الوطنيين والإقليميين والدوليين، بما يساهم في ترصيد المكتسبات وتطوير المنجزات ذات الصلة بحماية حقوق الإنسان والنهوض بها.